まず、iTunesでiPodが認識されてる状態で、「ディスクとして使用する」にチェックを入れて、
「適用」ボタンをクリックして、お使いのiPodに設定を適用させる必要がございます。

チェックが入っている状態でもuPodバックアップの画面で「接続されてません」と表示される場合は、
iTunesでiPodの接続を解除します。(iPodとパソコンはケーブルで繋いだままにしておきます)
開いているアプリケーションを全て終了し、パソコンを再起動します。
再起動が終わりましたら、uPodバックアップを起動して頂きiPodが認識されているか確認をお願いします。